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采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，降塵實驗室空白試樣是不稱取降塵樣品，按照與降塵試樣的制備相同步驟制備。
《水質 磷酸鹽的測定 離子色譜法》（HJ 669-2013）的樣品采集與保存規(guī)定，采集的樣品應經0.45μm微孔濾膜過濾，其濾液不加任何保存劑，收集于聚乙烯或玻璃瓶內，在0℃~4℃下可保存48h。
《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）規(guī)定，測定氯化氫所配的試劑均貯存于玻璃瓶中。
離子色譜法測定無機陰離子時，不被色譜柱保留或弱保留的陰離子干擾F-和Cl-測定時，用強淋洗液進行洗脫。
采用《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）測定固定污染源廢氣中的硫酸霧時，采樣使用的石英纖維濾筒無需前處理。
在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產生干擾。
采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定環(huán)境空氣和廢氣中氯化氫時，每次采集樣品應至少帶兩套全程序空白樣品。將同批次裝好吸收液的吸收瓶帶至采樣現場，不與采樣器連接，采樣結束后帶回實驗室待測。
離子色譜法測定環(huán)境空氣和廢氣中氯化氫時，樣品采集完畢，吸收液移入具塞比色管中定容后，即可直接在離子色譜儀上進樣分析。
《水質 無機陰離子（F-、Cl-、NO-2、Br-、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO42-4）的測定 離子色譜法》（HJ 84-2016）樣品的采集和保存規(guī)定，采集的樣品應盡快分析。若不能及時測定，于4℃以下冷藏、避光保存，測定前過濾。
《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）樣品運輸和保存規(guī)定，采集的樣品于0℃~4℃冷藏、密封可保存30天。