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在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產(chǎn)生干擾。
在離子色譜分析中，進樣體積大，水負峰亦大；淋洗液的濃度越高，水負峰越小。
離子色譜的電導檢測器內(nèi)，電極間的距離G越小，死體積越小，則靈敏度越低。
《水質 無機陰離子（F-、Cl-、NO-2、Br-、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO42-4）的測定 離子色譜法》（HJ 84-2016）樣品的采集和保存規(guī)定，采集的樣品應盡快分析。若不能及時測定，于4℃以下冷藏、避光保存，測定前過濾。
《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）中的水溶性陰離子是指環(huán)境空氣顆粒物樣品，在不加化學試劑的情況下用去離子水溶解的陰離子。
《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）適用于環(huán)境空氣顆粒物（包括TSP、PM10、PM2.5、降塵等）中水溶性陰離子的測定，也適用于在特殊天氣下，采集的顆粒物（如沙塵氣溶膠和沙塵暴降塵）樣品的分析。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，顆粒物濾膜全程序空白試樣的制備是使用與樣品采集同批次的空白濾膜，按照與顆粒物濾膜試樣的制備相同步驟制備。
采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定環(huán)境空氣中氯化氫時，將微孔濾膜裝在濾膜夾內(nèi)，后面串聯(lián)兩支各裝10ml吸收液的大型氣泡吸收管，用空氣采樣器進行采樣。
《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）的吸收液要臨用現(xiàn)配。
離子色譜法測定環(huán)境空氣和廢氣中氯化氫時，樣品采集完畢，吸收液移入具塞比色管中定容后，即可直接在離子色譜儀上進樣分析。