企業(yè)收到特別納稅調(diào)整風(fēng)險(xiǎn)提示或者發(fā)現(xiàn)自身存在特別納稅調(diào)整風(fēng)險(xiǎn)的，可以自行調(diào)整補(bǔ)稅。企業(yè)自行調(diào)整補(bǔ)稅的，稅務(wù)機(jī)關(guān)就不能按照有關(guān)規(guī)定實(shí)施特別納稅調(diào)查調(diào)整。

交易凈利潤(rùn)法一般適用于擁有重大價(jià)值無(wú)形資產(chǎn)企業(yè)的有形資產(chǎn)使用權(quán)或者所有權(quán)的轉(zhuǎn)讓和受讓、無(wú)形資產(chǎn)使用權(quán)受讓以及勞務(wù)交易等關(guān)聯(lián)交易。

境外所得的稅務(wù)檢查中，針對(duì)企業(yè)境外投資稅收管理的主要內(nèi)容和特點(diǎn)，各地應(yīng)規(guī)范境外所得納稅評(píng)估和稅務(wù)檢査操作程序，及時(shí)發(fā)現(xiàn)和處理企業(yè)境外投資的稅收風(fēng)險(xiǎn)。

對(duì)于實(shí)際管理機(jī)構(gòu)的判斷，應(yīng)當(dāng)遵循實(shí)質(zhì)重于形式的原則。

企業(yè)同時(shí)從事金融業(yè)務(wù)和非金融業(yè)務(wù)，其實(shí)際支付給關(guān)聯(lián)方的利息支出，應(yīng)按其他企業(yè)的標(biāo)準(zhǔn)比例計(jì)算準(zhǔn)予扣除的利息。

主管稅務(wù)機(jī)關(guān)作出的一般反避稅調(diào)整方案導(dǎo)致國(guó)內(nèi)雙重征稅的，由稅務(wù)總局統(tǒng)一組織協(xié)調(diào)解決。

企業(yè)僅與境內(nèi)關(guān)聯(lián)方發(fā)生關(guān)聯(lián)交易的，但達(dá)到了同期資料準(zhǔn)備標(biāo)準(zhǔn)的，也應(yīng)準(zhǔn)備主體文檔、本地文檔和特殊事項(xiàng)文檔。

在相互協(xié)商過(guò)程中，稅務(wù)機(jī)關(guān)可以要求企業(yè)進(jìn)一步補(bǔ)充提供資料，企業(yè)應(yīng)當(dāng)在規(guī)定的時(shí)限內(nèi)提交。

如果集團(tuán)內(nèi)一家企業(yè)被稅務(wù)機(jī)關(guān)實(shí)施特別納稅調(diào)查并已按主管稅務(wù)機(jī)關(guān)要求提供主體文檔，集團(tuán)內(nèi)其他企業(yè)不能免于提供主體文檔，但集團(tuán)仍然可以選擇其他任一企業(yè)主動(dòng)提供主體文檔，其他企業(yè)可在向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)書(shū)面報(bào)告情況后，免于提供。

稅務(wù)機(jī)關(guān)實(shí)施特別納稅調(diào)查過(guò)程中，需要被調(diào)查當(dāng)事人、證人陳述或者提供證言的，應(yīng)當(dāng)事先告知其不如實(shí)陳述或者提供虛假證言應(yīng)當(dāng)承擔(dān)的法律責(zé)任。被調(diào)查當(dāng)事人、證人可以采取書(shū)面或者口頭方式陳述或者提供證言，以口頭方式陳述或者提供證言的，調(diào)查人員可以筆錄、錄音、錄像。筆錄應(yīng)當(dāng)使用能夠長(zhǎng)期保持字跡的書(shū)寫(xiě)工具書(shū)寫(xiě)，也可使用計(jì)算機(jī)記錄并打印，陳述或者證言應(yīng)當(dāng)由被調(diào)查當(dāng)事人、證人在最后一頁(yè)簽章。