企業(yè)收到特別納稅調(diào)整風(fēng)險提示或者發(fā)現(xiàn)自身存在特別納稅調(diào)整風(fēng)險的，可以自行調(diào)整補(bǔ)稅。企業(yè)自行調(diào)整補(bǔ)稅的，稅務(wù)機(jī)關(guān)就不能按照有關(guān)規(guī)定實施特別納稅調(diào)查調(diào)整。

稅務(wù)機(jī)關(guān)實施特別納稅調(diào)查過程中，需要被調(diào)查當(dāng)事人、證人陳述或者提供證言的，應(yīng)當(dāng)事先告知其不如實陳述或者提供虛假證言應(yīng)當(dāng)承擔(dān)的法律責(zé)任。被調(diào)查當(dāng)事人、證人可以采取書面或者口頭方式陳述或者提供證言，以口頭方式陳述或者提供證言的，調(diào)查人員可以筆錄、錄音、錄像。筆錄應(yīng)當(dāng)使用能夠長期保持字跡的書寫工具書寫，也可使用計算機(jī)記錄并打印，陳述或者證言應(yīng)當(dāng)由被調(diào)查當(dāng)事人、證人在最后一頁簽章。

企業(yè)同時從事金融業(yè)務(wù)和非金融業(yè)務(wù)，其實際支付給關(guān)聯(lián)方的利息支出，應(yīng)按其他企業(yè)的標(biāo)準(zhǔn)比例計算準(zhǔn)予扣除的利息。

稅務(wù)機(jī)關(guān)已經(jīng)對企業(yè)實施特別納稅調(diào)整立案調(diào)查或者其他涉稅案件調(diào)查，且尚未結(jié)案的，稅務(wù)機(jī)關(guān)不可以拒絕企業(yè)提交談簽意向。

企業(yè)應(yīng)對境外分支機(jī)構(gòu)的實際虧損額與非實際虧損額不同的結(jié)轉(zhuǎn)彌補(bǔ)情況做好記錄。

預(yù)約定價安排執(zhí)行期滿，企業(yè)各年度經(jīng)營結(jié)果的算數(shù)平均值低于區(qū)間中位值，且未調(diào)整至中位值的，稅務(wù)機(jī)關(guān)不再受理續(xù)簽申請。

境外中資企業(yè)被判定為非境內(nèi)注冊居民企業(yè)的，按照企業(yè)所得稅法第四十五條以及受控外國企業(yè)管理的有關(guān)規(guī)定，不視為受控外國企業(yè)，但其所控制的其他受控外國企業(yè)仍應(yīng)按照有關(guān)進(jìn)行稅務(wù)處理。

在相互協(xié)商過程中，稅務(wù)機(jī)關(guān)可以要求企業(yè)進(jìn)一步補(bǔ)充提供資料，企業(yè)應(yīng)當(dāng)在規(guī)定的時限內(nèi)提交。

關(guān)聯(lián)債權(quán)比例是指企業(yè)從其全部關(guān)聯(lián)方接受的債權(quán)性投資占企業(yè)接受的權(quán)益性投資的比例，其中關(guān)聯(lián)債權(quán)投資不包括關(guān)聯(lián)方提供擔(dān)保的債權(quán)性投資。

對于實際管理機(jī)構(gòu)的判斷，應(yīng)當(dāng)遵循實質(zhì)重于形式的原則。