生物信息學(xué)章節(jié)練習(xí)(2020.05.17)

來源:考試資料網(wǎng)
1.名詞解釋空位罰分
參考答案:空位罰分是為了補(bǔ)償插入和缺失對序列相似性的影響,序列中的空位的引入不代表真正的進(jìn)化事件,所以要對其進(jìn)行罰分,空位罰分的多...
參考答案:它對每個可能的進(jìn)化位點分配一個概率,然后綜合所有位點,找到概率最大的進(jìn)化樹。最大似然法允許采用不同的進(jìn)化模型對變異進(jìn)行分...
參考答案:(1)選擇菜單file,
(2)選擇Text File Editor and Format Coverter工...
參考答案:核酸序列得分系統(tǒng)比較簡單,只需要考慮匹配、不匹配及空位罰分這三種情況;而蛋白序列比對就要復(fù)雜得多,除了考慮匹配和空位罰分...
6.名詞解釋標(biāo)度樹
參考答案:

指分支長度和相鄰節(jié)點對之間的差異成比例的系統(tǒng)發(fā)生樹。

7.名詞解釋極性鍵
參考答案:

在一個帶全正電的分子和另一個帶全負(fù)電的分子之間發(fā)生的相互作用。

參考答案:(1)多序列比對:ClustalW
(2)校對比對結(jié)果:BIOEDIT
(3)建樹:MEGA ...
參考答案:

在替換矩陣中,每個位置的打分是在相關(guān)蛋白局部比對模塊中觀察到的替換的頻率而獲得的,每個矩陣被修改成一個特殊的進(jìn)化距離。

10.名詞解釋二級結(jié)構(gòu)
參考答案:

指源自蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的α螺旋、β折疊等局部結(jié)構(gòu)特征。